Η περιπέτεια εκρήγνυται σε τρομερή δράση στο ντεμπούτο του Mewtwo, ένα βιονικό Πόκεμον που δημιουργήθηκε από το DNA του Mew, το σπανιότερο από όλα τα Πόκεμον. Αποφασισμένο να αποδείξει την υπεροχή του, ο Mewtwo οδηγεί τον Ας, τον Πίκατσου και τα άλλα Πόκεμον σε μια περιπέτεια που δεν έχει ξαναγίνει: ο Mewtwo εναντίον του Mew! Σούπερ κλώνοι εναντίον Πόκεμον! Είναι το απόλυτο σόου με το μέλλον του κόσμου σε κίνδυνο!